Récapitulatif exploration génétique et interprétation

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Récapitulatif exploration génétique et interprétation

Messagede un_ptit_gars » Dim 17 Juil 2016 12:07

Message de gogote
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Bonjour,

je me permets de faire un petit recap de sites qui pourraient en aider certains suite à l'analyse chez 23andme.

Au commencement :
Tout d'abord, la première étape sera de récupérer et télécharger son ficher raw de chez 23andme en fichier texte via leur site. Celui-ci vous servira toujours.
Notez cependant que la plupart des sites qui seront utilisés feront directement une liaison avec votre accord avec 23andme. Cela vous permettra de ne pas avoir à envoyer votre fichier raw data à chaque fois.

Décryptage de votre génome - fichier raw data :
Je conseille comme énoncé par Tollecausam, de convertir son fichier 23andme sur DNA.land, site totalement gratuit vous permettant de récupérer un fichier beaucoup plus volumineux en format .vcf qui après téléchargement et décompression fait près de 2,5go ! Dna.land permet en effet via ce fichier d'obtenir beaucoup plus de SNP que le génome raw de base de chez 23andme. Il faut 24h en moyenne pour que dna.land convertisse votre fichier de base et soit téléchargeable en vcf. A noter que le site vous permettra également et toujours gratuitement d'obtenir un rapport ancestry autre que celui de 23andme.

Une fois votre fichier VCF en possession, je vous conseille de passer par le site Prométhéase, qui pour 10$ vous donnera déjà de nombreuses informations sur vos risques éventuels via plus de 33 000 snp étudiés dans mon cas.
Prométhéase générera un rapport complet téléchargeable et consultable hors ligne, que vous pourrez aussi utilisé et partagé librement. Intéressant pour montrer à son médecin ses résultats.

Lien DNA.land : https://dna.land/
Lien Prométhéase : https://www.promethease.com/

Décrypter, analyser, échanger, expérimenter ( santé ) :
Pour ceux qui veulent aller plus loin, voici des sites énoncés que je conseille, sous-réserve d'actualisation du présent message si vous en connaissez d'autres :
Prométhéase (payant) - https://www.promethease.com/ : un peu le must-have pour débuter et avoir une première approche globale et concise.
Livewello (payant) - https://livewello.com/ : un monstre du partage avec des rapports sur des gènes mises en cause ou impliquées dans les pathologies, des rapports complets sur la méthylation et en tout genre, possibilité de comparer ses résultats, d'accéder à un tas d'études ( GWAS ), connaître ses risques sur nombres de pathologies, faire des liens, dialoguer avec des gens comme vous et moi etc .. long à prendre en main et à bien utiliser au début d'après-moi, mais réellement intuitif et intéressant !
DecodifyMe ( payant ) - https://www.decodify.me/
NutraHacker (payant)- https://www.nutrahacker.com/
SNPedialinks (gratuit) - https://snpedialinks.org/ : pour une première approche assez basique mais gratuite.
Infino me (gratuit)- https://www.infino.me/welcome : basique mais gratuit
Codegen (gratuit) - https://codegen.eu/
Geneticgenie - http://geneticgenie.org/ : accès méthylation/détox

En connaître plus sur vos origines et vos ancêtres :
Ancestry - http://home.ancestry.com/
Familytreedna - https://www.familytreedna.com/
Gedmatch ( gratuit ) - https://www.gedmatch.com/login1.php Très apprécié, complet et gratuit.

Bases de données - études en cours :
Il y a enfin tous les sites/bases de données d’où proviennent les conclusions et résultats que vous obtenez sur les différents sites mentionnés plus-haut :
DBsnp/ncbi - http://www.ncbi.nlm.nih.gov/
SNPdia - http://www.snpedia.com/index.php/SNPedia
Clinvar - http://www.ncbi.nlm.nih.gov/clinvar/
GWAS - http://www.gwascentral.org/
Omim - http://www.omim.org/
Malacards - http://www.malacards.org/
Alfred med - https://alfred.med.yale.edu/alfred/index.asp

Pour aller encore plus loin :
Je ne vais pas encore l'évoquer car pas encore assez calé sur le sujet et on entre dans le complexe, mais il y a aussi des programmes permettant de séquencer soi-même son génome et bien triper. Mais je n'ai pas encore ces compétences donc je laisse cela aux plus compétents s'ils désirent l'évoquer. J'actualiserai ce post fonction de nouveaux sites et découvertes, le listing actuel étant loin d'être exhaustif. J'hésite par ailleurs à créer un post uniquement en ce sens pour une meilleure visibilité et aider les personnes qui comme moi sont des charognards de la découverte génétique et aiment en apprendre toujours plus, et fouillent à droite à gauche ! Mais tout simplement aussi pour aider et faire gagner beaucoup de temps de recherches.

Je prévois pour un post encore plus complet, intuitif et simple pour les nocives, d'ajouter au besoin des captures écrans pour vous aider sur ces principaux sites.
Rappel : Aucun message posté ici ne fait office de prescription médicale, seul le médecin traitant est habilité à prescrire un traitement- www.forum-melodie.fr/phpBB3/viewtopic.php?f=53&t=2869

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Re: Récapitulatif exploration génétique et interprétation

Messagede un_ptit_gars » Dim 17 Juil 2016 12:11

Il y a aussi l'analyse StrateGene Strategic Genetic Analysis , issu du Dr Lynch qui semble etre réellement TRES intéréssante.

https://seekinghealth.org/product/genet ... filiate=33
https://seekinghealth.org/product/pathw ... -download/

Pti gars
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Re: Récapitulatif exploration génétique et interprétation

Messagede La_Mist » Dim 5 Mar 2017 13:01

Personne n'a essayé Strategene du coup ?
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Re: Récapitulatif exploration génétique et interprétation

Messagede un_ptit_gars » Jeu 9 Mar 2017 13:54

La_Mist a écrit:Personne n'a essayé Strategene du coup ?


A priori non... mais nous n'attendons plus que tes retours pour nous motiver, alors lance toi en première! :gla:

Pti gars
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