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Re: Test généraliste et super utile... 23andme! :)

MessagePosté: Mar 17 Mai 2016 23:49
de gogote
Bonjour,

je me permets de faire un petit recap de sites qui pourraient en aider certains suite à l'analyse chez 23andme.

Au commencement :
Tout d'abord, la première étape sera de récupérer et télécharger son ficher raw de chez 23andme en fichier texte via leur site. Celui-ci vous servira toujours.
Notez cependant que la plupart des sites qui seront utilisés feront directement une liaison avec votre accord avec 23andme. Cela vous permettra de ne pas avoir à envoyer votre fichier raw data à chaque fois.

Décryptage de votre génome - fichier raw data :
Je conseille comme énoncé par Tollecausam, de convertir son fichier 23andme sur DNA.land, site totalement gratuit vous permettant de récupérer un fichier beaucoup plus volumineux en format .vcf qui après téléchargement et décompression fait près de 2,5go ! Dna.land permet en effet via ce fichier d'obtenir beaucoup plus de SNP que le génome raw de base de chez 23andme. Il faut 24h en moyenne pour que dna.land convertisse votre fichier de base et soit téléchargeable en vcf. A noter que le site vous permettra également et toujours gratuitement d'obtenir un rapport ancestry autre que celui de 23andme.

Une fois votre fichier VCF en possession, je vous conseille de passer par le site Prométhéase, qui pour 10$ vous donnera déjà de nombreuses informations sur vos risques éventuels via plus de 33 000 snp étudiés dans mon cas.
Prométhéase générera un rapport complet téléchargeable et consultable hors ligne, que vous pourrez aussi utilisé et partagé librement. Intéressant pour montrer à son médecin ses résultats.

Lien DNA.land : https://dna.land/
Lien Prométhéase : https://www.promethease.com/

Décrypter, analyser, échanger, expérimenter ( santé ) :
Pour ceux qui veulent aller plus loin, voici des sites énoncés que je conseille, sous-réserve d'actualisation du présent message si vous en connaissez d'autres :
Prométhéase (payant) - https://www.promethease.com/ : un peu le must-have pour débuter et avoir une première approche globale et concise.
Livewello (payant) - https://livewello.com/ : un monstre du partage avec des rapports sur des gènes mises en cause ou impliquées dans les pathologies, des rapports complets sur la méthylation et en tout genre, possibilité de comparer ses résultats, d'accéder à un tas d'études ( GWAS ), connaître ses risques sur nombres de pathologies, faire des liens, dialoguer avec des gens comme vous et moi etc .. long à prendre en main et à bien utiliser au début d'après-moi, mais réellement intuitif et intéressant !
DecodifyMe ( payant ) - https://www.decodify.me/
NutraHacker (payant)- https://www.nutrahacker.com/
SNPedialinks (gratuit) - https://snpedialinks.org/ : pour une première approche assez basique mais gratuite.
Infino me (gratuit)- https://www.infino.me/welcome : basique mais gratuit
Codegen (gratuit) - https://codegen.eu/
Geneticgenie - http://geneticgenie.org/ : accès méthylation/détox

En connaître plus sur vos origines et vos ancêtres :
Ancestry - http://home.ancestry.com/
Familytreedna - https://www.familytreedna.com/
Gedmatch ( gratuit ) - https://www.gedmatch.com/login1.php Très apprécié, complet et gratuit.

Bases de données - études en cours :
Il y a enfin tous les sites/bases de données d’où proviennent les conclusions et résultats que vous obtenez sur les différents sites mentionnés plus-haut :
DBsnp/ncbi - http://www.ncbi.nlm.nih.gov/
SNPdia - http://www.snpedia.com/index.php/SNPedia
Clinvar - http://www.ncbi.nlm.nih.gov/clinvar/
GWAS - http://www.gwascentral.org/
Omim - http://www.omim.org/
Malacards - http://www.malacards.org/
Alfred med - https://alfred.med.yale.edu/alfred/index.asp

Pour aller encore plus loin :
Je ne vais pas encore l'évoquer car pas encore assez calé sur le sujet et on entre dans le complexe, mais il y a aussi des programmes permettant de séquencer soi-même son génome et bien triper. Mais je n'ai pas encore ces compétences donc je laisse cela aux plus compétents s'ils désirent l'évoquer. J'actualiserai ce post fonction de nouveaux sites et découvertes, le listing actuel étant loin d'être exhaustif. J'hésite par ailleurs à créer un post uniquement en ce sens pour une meilleure visibilité et aider les personnes qui comme moi sont des charognards de la découverte génétique et aiment en apprendre toujours plus, et fouillent à droite à gauche ! Mais tout simplement aussi pour aider et faire gagner beaucoup de temps de recherches.

Je prévois pour un post encore plus complet, intuitif et simple pour les nocives, d'ajouter au besoin des captures écrans pour vous aider sur ces principaux sites.

Re: Test généraliste et super utile... 23andme! :)

MessagePosté: Mer 18 Mai 2016 07:09
de un_ptit_gars
Très bonne idée de faire ici un post récapitulatif, parceque c'est vrai qu'entre tous les sites émergeants on fini vite par s'y emmêler les pinceaux et en oublier la moitié! :D

Merci gogote! :)

Pti gars

Re: Test généraliste et super utile... 23andme! :)

MessagePosté: Mer 18 Mai 2016 12:21
de beacam
Merci pour le topo, ça y est je viens de commander mon kit, à suivre

Re: Test généraliste et super utile... 23andme! :)

MessagePosté: Jeu 26 Mai 2016 14:44
de beacam
Dites moi combien de temps pour recevoir le kit ?

Re: Test généraliste et super utile... 23andme! :)

MessagePosté: Jeu 26 Mai 2016 16:06
de Kali
Ils disent 2-3 semaines pour la France.

Re: Test généraliste et super utile... 23andme! :)

MessagePosté: Jeu 26 Mai 2016 20:36
de beacam
Ah OK merci kali je croyais que c était le délai pour recevoir les résultats mais pas le kit pour faire l analyse, tu l as faite toi ?

Re: Test généraliste et super utile... 23andme! :)

MessagePosté: Dim 29 Mai 2016 09:55
de un_ptit_gars
beacam a écrit:Ah OK merci kali je croyais que c était le délai pour recevoir les résultats mais pas le kit pour faire l analyse, tu l as faite toi ?


De souvenir, le délai pour avoir ses résultats une fois l'analyse faite est bien plus long que ça: environ 2 mois je crois... Peut etre se sont-ils améliorés depuis, mais y a 1 an c'était a peu près ça.

Pti gars

Re: Test généraliste et super utile... 23andme! :)

MessagePosté: Dim 29 Mai 2016 14:58
de gogote
Ils viennent depuis quelques semaines de modifier les délais pour les résultats après réception de votre kit : initialement de 6 à 8 semaines, c'est dorénavant de 10 à 12 semaines. Pour ma part, j'ai attendu 8 semaines pour les avoir. Ma soeur seulement 2 semaines et demi !! ( mais j'imagine que c'est du à nos 53% d'adn en commun )

Concernant la réception du kit, c'est en général assez rapide. ( 1 semaine dans mon cas pour le recevoir, et 3 à 5 jours pour qu'ils le réceptionne )

Re: Test généraliste et super utile... 23andme! :)

MessagePosté: Mar 31 Mai 2016 11:32
de beacam
Bon j ai reçu mon kit et je suis un peu perdue
Il me semble que l on doit donner son accord pour l utilisation , est ce que c est au moment des conditions générales ou plus tard
Et pour l envoi est ce que quelqu un peut me dire comment faire étiquette etc l anglais n étant pas ma première langue
Help

Re: Test généraliste et super utile... 23andme! :)

MessagePosté: Mer 1 Juin 2016 16:07
de gogote
Salut bea,

je t'ai répondu via MP.
Pour vos envois, il suffit de ne conserver que le tube dans lequel vous avez craché, que vous remettez à l'intérieur de l'enveloppe à rabat, que vous fermez avec l'étiquette collante.
Vous ne touchez à aucun des éléments et papiers à l'intérieur de l'enveloppe, c'est pour les passages aux douanes. Vous pouvez par contre jeter la boite cartonnée 23andme.

Une fois cela fait, il suffit d'appeler Fedex proche de chez vous et convenir d'un rdv pour qu'ils viennent directement chercher l'enveloppe chez vous. Tout est gratuit.
Vous avez aussi le choix de vous rendre directement dans un centre Fedex mais perso, je ne me suis pas privé de les appeler !

Le reste du suivi se fait via leur site qui vous informera de la réception de votre échantillon et de l'évolution des analyses par étapes.
( ça peut être long, ils ont augmenté de 8 à 12 semaines les délais. Tiens nous au courant quand tu auras les résultats, puisque je compte faire un nouvel envoi prochainement )

Re: Test généraliste et super utile... 23andme! :)

MessagePosté: Mer 1 Juin 2016 16:19
de beacam
Salut gogote, merci je viens de voir ton mp..

Re: Test généraliste et super utile... 23andme! :)

MessagePosté: Ven 15 Juil 2016 12:08
de xavtls
Il y a aussi le laboratoire 4PGENOMICS qui propose une analyse DETOX (entre autres) :

https://www.labo.lu/fr/prestations/mede ... oxgen.html

Je ne connais pas le coût, j'ai posé la question, j'attends la réponse du laboratoire.

Re: Test généraliste et super utile... 23andme! :)

MessagePosté: Sam 16 Juil 2016 12:11
de xavtls
Le coût du DetoxGen est de 379 €.

Un autre test intéressant est le OxiGen à 295 €.
https://www.labo.lu/fr/prestations/mede ... xigen.html

Re: Test généraliste et super utile... 23andme! :)

MessagePosté: Dim 17 Juil 2016 11:19
de xavtls
Pour ceux qui souhaitent comprendre la génétique, il y a un mooc sur coursera :
https://www.coursera.org/learn/genetics-evolution

Le cours commence demain et se termine le 9 octobre.

Re: Test généraliste et super utile... 23andme! :)

MessagePosté: Mar 2 Aoû 2016 19:09
de marfansyndrome
Bonjour,je vous explique mon cas:

Je suis un peu hypocondriaque et j'ai entre autre peur d'avoir le syndrome de marfan, en effet j'ai plusieurs symptome : Grande taille, scoliose pied plat, faciès ...

Par contre je n'ai pas de problème cardiaque ou de problème de vue ( qui sont caractéristique du syndrome)

Afin de me rassurer,est -ce que vous connaissez pas des organisme en France ou aux états unis qui peuvent faire des biopsie de peau ? en effet la biopsie de peau permet d'évaluer la qualité de la fibriline

Je suis prêt à payer chère pour ça